Praktikdelen af uddannelsen udgør 85 uger af de 2 år, uddannelsen varer. Man er i 4 forskellige afdelinger i løbet af elevtiden.
De to første afdelinger er planlagt på forhånd, når uddannelsen starter, mens man selv har mulighed for at ønske afdelinger i andet år.
På flere afdelinger er lægesekretærerne i aften-, natte- og weekendvagter. Nogle steder er det valgfrit for eleven at deltage i vagterne, andre steder, fx i Skadestuen, får eleven sit eget vagtrul, som ligner de uddannede lægesekretærers.
Mødetider er forskellig i de enkelte afdelinger og er afhængig af lægesekretærernes arbejdstidsplanlægning.
I alle afdelinger er der en elevansvarlig lægesekretær, som har ansvar for elevforløbet og de samtaler og evalueringer, som ligger undervejs.