Som led i Region Hovedstadens hospitalsplan skal Hvidovre Hospitals Børneafdeling være børneafdeling i planlægningsområde Syd.Afdelingen varetager som almen pædiatrisk afdeling diagnostik og behandling af et bredt spektrum af medicinske sygdomme hos børn fra 0 til og med 15 år. Derudover modtager afdelingen børn med ortopæd- og gastrokirurgiske sygdomme, som behandles i samarbejde med ortopædkirurgisk og gastrokirurgisk afdeling.Afdelingen har højt specialiseret funktion i medicinsk gastroenterologi, HIV/AIDS og erhvervet hjerneskade. Afdelingen har regionsfunktion for viral hepatitis, tuberkulose, tropepædiatri og neonatologi. I neonatalafsnittet behandles syge nyfødte og præmature med gestationsalder 28. uge og derover.Børneafdelingen er normeret til 207 ansatte,som er fordelt på følgende faggrupper:
Derudover har afdelingen 2 skolelærere, som er ansat af Hvidovre Kommune.